Пособие «Аминокислоты, пептиды, белки» включает в свое содержание аминокислотную номенклатуру. В первую очередь это касается природных, протеиногенных и непротеиногенных аминокислот. В отдельной главе автор говорит об аминокислотной стереохимии, физико-химических свойствах и их получении. Здесь говорится о выделении аминокислот из белкового гидролизата, применении микробиологических, ферментативных и методов химического синтеза.
Якубе также акцентирует внимание читателя на аминокислотном анализе, специфических реакциях аминокислот и других моментах. Дано подробное описание пептидам, где указаны их свойства, говорится о пептидном синтезе, биологически активных пептидах и т.д.
Приведена также информация, касающаяся белков. Указывается их значение, классификация, процессы выделения и очистки. Говорится об количественном обнаружении и отделении белков, их физико-химических свойствах, структурной организации и биосинтезе.