Яковлев в своей книге «Ботаника» говорит о строении растительных, прокариотических и эукариотических клеток. Произведен структурный анализ растительных и грибных клеток. В описываемой книге Яковлева также представлены знания о тканях, а именно покрывных, механических, проводящих, основных и выделительных (секреторных) тканях; о вегетативных органах высших растений: эмбриогенез и органогенез, побег и корень, почка, стебель и лист. Также в ботанике говорится про физиологию, размножение и систематику растений. Яковлев приводит систематику всего живого. Это касается дробянок, грибов, водорослей, растений, голосеменных, покрытосеменных. В содержание книги «Ботаника» также включены знания о , цветках и их строении и много другое.