Книга «Физиология растений» Малиновского повествует о физиологии растительных клеток, а именно о водном обмене и значении водных ресурсов для растений. Отдельная глава книги посвящена формам воды в растениях, корневым системам как органам, поглощающим воду. Не обошлось и без описания особенностей водного обмена у растений, принадлежащим разным экологическим группам. Описывается минеральное питание и почва в качестве источника питательного вещества. В книгу включены сведения о физиолого-биохимической роли основного элемента питания.
В книге «Физиология растений» Малиновский приводит описание применения удобрений, процесса фотосинтеза, пигментов, хлорофиллов, каротиноидов, фикобилинов, световой фазы фотосинтеза, поглощения света и возбуждения хлорофилла. Не оставлены без описания и темновые фазы фотосинтеза, фотодыхание. Уделено внимание брожению, гликолизу, циклу трикарбоновой кислоты, гетеротрофному способу питания растений и выделению веществ.