Второй том книги «Гены и геномы» приводит описание молекулярной организации, экспрессии и регуляции генов эукариот. Говорится о структуре и регулируемой экспрессии эукариот генов, а именно это касается структуры и экспрессии генов принадлежащих различным классам, интронов, метилировании ДНК, транскриминации и терминации). Дано подробное описание молекулярной структуре эукариотических генов (гены, кодирующие РНК и белки, геномы органел эукариот); реорганизация генома (ретротранспазоны, ретрогены, амплификация).
Отдельная часть пособия посвящена исследованиям биологической системы и различных манипуляций с ней: картирование геномов, изменение биологических систем и других.