Книга Биоорганическая химия Овчинникова богата на иллюстрации и в ней подробно описаны все классы веществ: белки и пептиды (аминокислоты, модификация белков, строение и функции белков, денатурация белков, синтез белков, ферменты, активный центр, биологическая роль пептидов, пептидные гормоны и др.). В книге Биоорганическая химия Овчинников описывает нуклеиновые кислоты (строение и синтез нуклеиновых кислот, ДНК, РНК, нуклеопротеиды, репликация, транскрипция, трансляция, модификация нуклеиновых кислот, генная инженерия и др.). Книга Биоорганическая химия Овчинникова также повествует про углеводы (строение углеводов и углеводсодержащих биополимеров, синтез углеводов); липиды и биологические мембраны; низкомолекулярные биорегуляторы (витамины, пестициды, регуляторы роста, алкалоиды, стероиды, яды, терпены, феромоны и антибиотики).